شناسایی جهش های سرطانی با روش هوش مصنوعی
شاه بلاگ: شاه بلاگ: پژوهشگران سنگاپوری، یک روش جدید مبتنی بر هوش مصنوعی را ابداع نموده اند که می تواند جهش های عامل سرطان را با دقت بالایی شناسایی کند.
به گزارش شاه بلاگ به نقل از ایسنا و به نقل از وب سایت رسمی "موسسه ژنوم سنگاپور"(GIS)، پژوهشگران یک روش جدید مبتنی بر هوش مصنوعی موسوم به "VarNet" ابداع نموده اند که می تواند جهش های عامل انواع سرطان را در میلیونها قطعه DNA که در یک دستگاه قرار دارند، بررسی و شناسایی کند. این روش مانند یک قطب نمای کلیدی در هدایت راهبردهای درمانی شخصی سازی شده برای مبارزه با سرطان عمل می کند. روش VarNet را می توان هم در محیط های بالینی و هم در حوزه های پژوهشی برای تحلیل و بررسی جهش ها به کار گرفت تا راهبردهای درمانی را عرضه نماید یا به درک بهتر سرطان کمک نماید.
سرطان، در اثر جهش هایی ایجاد می شود که در طول عمر یک شخص به وجود می آیند. شناسایی این جهش ها، یک چالش بلندمدت بوده است که باید برای توسعه راهبردهای درمانی شخصی سازی شده و ارائه درمان مناسب به بیمار مناسب در زمان مناسب برطرف شود. پژوهش موسسه ژنوم سنگاپور، برای رسیدگی به این چالش انجام شده است.
روش VarNet، از یادگیری عمیق استفاده می نماید که یک روش مبتنی بر هوش مصنوعی، برای شناسایی جهش های سرطانی بدون دانش تخصصی در زمینه سرطان و ژنومیک است. این روش با مقادیر قابل توجهی از داده های توالی یابی سرطان آموزش دید که از پایگاه های داده سنگاپور و پایگاه های بین المللی به دست آمده بودند. هنگامی که VarNet با معیارهای تومور واقعی ارزیابی شد، از نظر دقت توانست از الگوریتم های فعلی شناسایی جهش فراتر رود. شناسایی دقیق جهش ها در تومورها، بر تحلیل و بررسی ها تأثیر می گذارد و می تواند نتایج تحقیقات و تصمیمات درمانی را نیز تحت تأثیر قرار دهد.
دکتر "اندرس اسکندروپ"(Anders Skanderup)، سرپرست این پژوهش اظهار داشت: ما مدتی است که روی روش های یادگیری ماشینی برای بهبود تشخیص جهش های سرطان کار می نماییم. طی روند این کار، متوجه شدیم که متخصصان انسانی اغلب در پروسه تأیید جهش های سرطان با اطمینان بالا شرکت دارند.
وی ادامه داد: متخصصان انسانی با بررسی تصاویری از DNA که جهش های بالقوه را شامل می شود، تصمیم می گیرند. با این وجود، در صورتیکه یک انسان می تواند این کار را فقط برای چند جهش و در مدت زمان محدود انجام دهد، یک روش مبتنی بر هوش مصنوعی شاید بتواند همان کار را روی سه میلیارد نوکلئوتید در ژنوم انسان انجام دهد. این موضوع، الهام بخش ما شد تا از روش های یادگیری عمیق استفاده نمائیم که الگوهای موجود در تصاویر را یاد می گیرند و یک روش خالص مبتنی بر هوش مصنوعی را برای شناسایی جهش های سرطان ایجاد می کنند.
"کایران کریشناماچاری"(Kiran Krishnamachari)، از پژوهشگران این پروژه اشاره کرد: این سیستم توانست یاد بگیرد که جهش ها را از داده های خام و به روشی تشخیص دهد که یک متخصص انسانی هنگام بررسی دستی انجام می دهد تا جهش های بالقوه را شناسایی کند. این مساله به ما اطمینان داد که اگر سیستم با مجموعه گسترده ای از داده ها آموزش ببیند، می تواند خاصیت های مربوط به جهش ها را با بهره گیری از راهبردهای نظارتی که نیازی به برچسب گذاری دستی بیش از حد ندارند، یاد بگیرد.
پروفسور "پاتریک تان"(Patrick Tan)، مدیر اجرائی موسسه ژنوم سنگاپور اظهار داشت: شناسایی جهش های سرطان، گامی حیاتی در توسعه پزشکی دقیق است. روش VarNet نشان میدهد که یادگیری عمیق می تواند جهش های سرطانی را با دقتی تشخیص دهد که اغلب بیش از دقت روش های پیشرفته موجود است.
این پژوهش، در مجله "Nature Communications" به چاپ رسید.
این مطلب را می پسندید؟
(1)
(0)
تازه ترین مطالب مرتبط
نظرات بینندگان در مورد این مطلب